กรด 3-(ไตรฟลูออโรมิทอกซิ)พิโคลินิก ถูกนำมาใช้เป็นหลักในด้านเคมีเกษตร เป็นตัวกลางสำคัญในการสังเคราะห์สารกำจัดวัชพืช คุณสมบัติทางโครงสร้างทำให้มีประสิทธิภาพในการกำหนดเป้าหมายและยับยั้งเอนไซม์เฉพาะในวัชพืช ซึ่งช่วยเพิ่มการปกป้องพืชผล นอกจากนี้ ยังมีการประยุกต์ใช้ในการวิจัยเภสัชกรรม โดยทำหน้าที่เป็นส่วนประกอบพื้นฐานในการพัฒนาสารประกอบที่มีศักยภาพทางรักษา โดยเฉพาะในการออกแบบโมเลกุลที่กำหนดเป้าหมายไปยังความผิดปกติทางระบบประสาทและโรคการอักเสบ กลุ่มไตรฟลูออโรมิทอกซิช่วยเพิ่มความเสถียรทางเมแทบอลิซึมและการดูดซึมทางชีวภาพ ทำให้มีคุณค่าต่อกระบวนการค้นพบยา