2-Bromo-4-methoxy-3-methylpyridine ใช้เป็นสารกลางในการสังเคราะห์เภสัชภัณฑ์ โดยเฉพาะในการพัฒนาส่วนประกอบยาสำคัญ (APIs) สำหรับยารักษาโรค มันมีบทบาทในการสร้างโมเลกุลอินทรีย์ที่ซับซ้อนเนื่องจากมีกลุ่มโบรมีนและเมทอกซีที่ทำปฏิกิริยาได้ ซึ่งช่วยอำนวยในการทำปฏิกิริยาการจับคู่และการแทนที่ต่างๆ นอกจากนี้ ยังใช้ในการวิจัยสารเคมีเกษตรสำหรับสร้างสารประกอบที่มีคุณสมบัติกำจัดศัตรูพืชหรือวัชพืชที่เป็นไปได้ คุณสมบัติโครงสร้างของมันทำให้มีคุณค่าในการเคมียารักษาโรคสำหรับการออกแบบโมเลกุลที่มีกิจกรรมทางชีวภาพเฉพาะเจาะจง