2-Chloro-3-(chloromethyl)pyridine ใช้เป็นสารตั้งต้นในการสังเคราะห์สารเคมีต่าง ๆ โดยเฉพาะในอุตสาหกรรมยาและเกษตรกรรม ในด้านยา สารนี้ถูกนำไปใช้ในการผลิตยาต้านจุลชีพและยารักษาโรคอื่น ๆ เนื่องจากโครงสร้างโมเลกุลที่สามารถปรับเปลี่ยนได้ง่าย ทำให้เหมาะสำหรับการพัฒนายาใหม่ ๆ นอกจากนี้ ยังใช้ในการผลิตสารกำจัดศัตรูพืชและสารเคมีป้องกันพืช โดยช่วยเพิ่มประสิทธิภาพในการควบคุมศัตรูพืชและโรคพืช เนื่องจากมีความเสถียรและปฏิกิริยาที่หลากหลาย