กรด 2-อะมิโน-6-เมทอกซินิโคตินิก ใช้หลักในฐานะสารกลางในการสังเคราะห์สารประกอบทางเภสัชกรรมต่างๆ โดยมีบทบาทสำคัญในการพัฒนายาที่มุ่งเป้าไปยังความผิดปกติทางระบบประสาท โดยเฉพาะอย่างยิ่งในฐานะสารตั้งต้นในการผลิตอนุพันธ์กรดนิโคตินิก อนุพันธ์เหล่านี้มักถูกสำรวจสำหรับศักยภาพในการรักษาโรคอัลไซเมอร์และความบกพร่องทางความรู้ความเข้าใจอื่นๆ นอกจากนี้ ยังถูกนำมาใช้ในการสร้างสารเคมีเกษตร สนับสนุนการพัฒนายาฆ่าหญ้าและยาฆ่าแมลง คุณสมบัติทางโครงสร้างทำให้เป็นหน่วยย่อยที่มีคุณค่าในการสังเคราะห์อินทรีย์ ซึ่งช่วยในการสร้างโมเลกุลที่ซับซ้อนที่มีการประยุกต์ใช้ทางบำบัดและการเกษตร