2-Amino-4,6-dichloronicotinaldehyde ใช้หลักๆ ในการสังเคราะห์อินทรีย์ โดยทำหน้าที่เป็นสารกลางสำคัญในการผลิตเภสัชภัณฑ์และสารเคมีเกษตร มันมีคุณค่าอย่างยิ่งในการพัฒนาสารประกอบเฮเตอร์โรไซคลิก ซึ่งจำเป็นในการสร้างยาที่มีคุณสมบัติต้านแบคทีเรีย ต้านเชื้อรา และต้านไวรัส นอกจากนี้ ยังมีบทบาทในการสังเคราะห์โมเลกุลซับซ้อนสำหรับวัตถุประสงค์การวิจัย ช่วยในการค้นพบตัวแทนบำบัดใหม่ กลุ่มอัลดีไฮด์ที่ทำปฏิกิริยาและอะตอมคลอรีนทำให้มันเป็นบล็อกสร้างที่หลากหลายในปฏิกิริยาเคมีต่างๆ รวมถึงการแทนที่นิวคลีโอฟิลิกและการควบแน่น