2-Amino-3-fluoroisonicotinic acid ถูกใช้หลักในการวิจัยเภสัชกรรม สารประกอบนี้ทำหน้าที่เป็นสารกลางสำคัญในการสังเคราะห์ยาตัวต่างๆ โครงสร้างของมันมีคุณค่าอย่างยิ่งในการพัฒนาโมเลกุลที่มีศักยภาพในการต้านการอักเสบ ต้านจุลินทรีย์ และต้านมะเร็ง การมีอะตอมฟลูออรีนช่วยเพิ่มกิจกรรมทางชีวภาพและความเสถียรทางเมแทบอลิซึมของสารประกอบที่ได้ นอกจากนี้ ยังถูกนำมาใช้ในการสร้างสารประกอบเฮเตอโรไซคลิกใหม่ๆ ซึ่งถูกสำรวจสำหรับการประยุกต์ใช้ทางรักษาในการกำหนดเป้าหมายเอนไซม์หรือตัวรับเฉพาะ นอกจากนี้ ยังมีบทบาทในการพัฒนาตัวแทนวินิจฉัยและโปรบการถ่ายภาพเนื่องจากคุณสมบัติทางเคมีที่เป็นเอกลักษณ์