2-Fluoro-5-methylpyridin-4-amine ใช้เป็นสารตั้งต้นสำคัญในการสังเคราะห์เภสัชภัณฑ์ โดยเฉพาะในการพัฒนายาที่มุ่งเป้าไปยังโรคทางระบบประสาทและโรคติดเชื้อ โครงสร้างของสารนี้มีคุณค่าในการสร้างสารประกอบที่มีศักยภาพทางรักษา นอกจากนี้ยังมีบทบาทในการวิจัยสารเคมีเกษตรสำหรับพัฒนายาฆ่าแมลงและสารกำจัดวัชพืชใหม่ กลุ่มฟลูออรีนและอะมีนของสารประกอบช่วยเพิ่มความสามารถในการเกิดปฏิกิริยาและคุณสมบัติการจับมัด ทำให้มีประโยชน์ในเภสัชเคมีและการประยุกต์ใช้วิทยาศาสตร์วัสดุ