2-(Chloromethyl)-3,4-dimethoxypyridine 1-oxide เป็นสารประกอบที่ถูกนำมาใช้เป็นหลักในการสังเคราะห์สารกลางทางเภสัชกรรม โดยเฉพาะในการพัฒนายาเป้าหมายโรคหัวใจและหลอดเลือด รวมถึงภาวะทางระบบประสาท โครงสร้างของสารนี้ช่วยให้ทำหน้าที่เป็นบล็อกก่อสร้างที่หลากหลายในการสังเคราะห์อินทรีย์ ทำให้สามารถนำเข้าฟังก์ชันกรุ๊ปที่สำคัญต่อกิจกรรมทางชีวภาพ นอกจากนี้ ยังถูกใช้ในการเตรียมโมเลกุลซับซ้อนสำหรับวัตถุประสงค์การวิจัย ช่วยในการศึกษาการโต้ตอบระหว่างยาและตัวรับยา นอกจากนี้ ยังมีการประยุกต์ใช้ในการผลิตสารเคมีเกษตร ซึ่งมีส่วนช่วยในการสร้างสารประกอบที่มีคุณสมบัติกำจัดวัชพืชหรือกำจัดศัตรูพืช