สารประกอบนี้ถูกนำไปใช้หลักๆ ในอุตสาหกรรมเภสัชกรรมและเกษตรเคมี เป็นสารกลางสำคัญในการสังเคราะห์ส่วนประกอบที่ออกฤทธิ์ ในเภสัชกรรม มักใช้ในการพัฒนายาใหม่ โดยเฉพาะยาที่เล็งเป้าไปยังเอนไซม์หรือตัวรับเฉพาะในการรักษาโรคต่างๆ เช่น มะเร็ง การติดเชื้อ หรือโรคทางระบบประสาท โครงสร้างฟลูออรีนที่เป็นเอกลักษณ์ช่วยเพิ่มการดูดซึมทางชีวภาพและความเสถียรทางเมแทบอลิซึมของสารประกอบที่ได้ ในเกษตรเคมี ทำหน้าที่เป็นส่วนประกอบพื้นฐานในการสร้างยาฆ่าแมลงหรือสารกำจัดวัชพืชขั้นสูง โดยอะตอมฟลูออรีนช่วยเพิ่มประสิทธิภาพและความคงทนต่อสิ่งแวดล้อม ความยืดหยุ่นในการสังเคราะห์อินทรีย์ยังทำให้มีคุณค่าในการวิจัยและพัฒนาเคมียารักษาโรค