2-(2,2,2-ไตรฟลูออโรเอทอกซี)นิโคตินาลดีไฮด์ ใช้ในการสังเคราะห์ยา โดยเฉพาะในการพัฒนาสารออกฤทธิ์ทางเภสัชกรรม (APIs) ที่มีศักยภาพในการรักษา มันทำหน้าที่เป็นสารตั้งต้นสำคัญในการผลิตสารประกอบที่มุ่งเป้าไปยังความผิดปกติทางระบบประสาท เช่น โรคลมชักและความวิตกกังวล เนื่องจากความสามารถในการปรับเปลี่ยนกิจกรรมของตัวรับ นอกจากนี้ ยังถูกนำมาใช้ในการวิจัยสารเคมีเกษตรเพื่อสร้างยาฆ่าแมลงและสารกำจัดวัชพืชใหม่ๆ โดยใช้กลุ่มไตรฟลูออโรเอทอกซีเพื่อเพิ่มกิจกรรมทางชีวภาพ ในด้านวิทยาศาสตร์วัสดุ มันถูกนำมาใช้ในการออกแบบโมเลกุลอินทรีย์ขั้นสูงสำหรับการประยุกต์ใช้ทางโฟโตอิเล็กทรอนิกส์ ซึ่งมีส่วนช่วยในการพัฒนาไดโอดแสงสว่าง (LEDs) และเซมิคอนดักเตอร์อินทรีย์ โครงสร้างที่ไม่เหมือนใครของมันยังมีคุณค่าในการสังเคราะห์อินทรีย์สำหรับการสร้างโมเลกุลซับซ้อนที่มีกลุ่มฟังก์ชันเฉพาะ