2,3-Dichloro-5-iodopyridine ใช้หลักๆ ในการสังเคราะห์อินทรีย์เป็นบล็อกก่อสร้างสำหรับโมเลกุลที่ซับซ้อนมากขึ้น โดยเฉพาะในอุตสาหกรรมเภสัชกรรมและเคมีเกษตร เป็นสารกลางสำคัญในการผลิตส่วนประกอบยาสำคัญ (APIs) และสารป้องกันพืช โครงสร้างที่ถูกฮาโลเจนทำให้มีปฏิกิริยาที่หลากหลาย สามารถนำเข้าฟังก์ชันกรุ๊ปต่างๆ ผ่านปฏิกิริยาการแทนที่ นอกจากนี้ ยังใช้ในการพัฒนาคอมพาวด์เฮเทอโรไซคลิก ซึ่งสำคัญในกระบวนการค้นพบยาและวิทยาศาสตร์วัสดุ กลุ่มไอโอดีนทำให้มีประโยชน์ในปฏิกิริยาครอส-คัปปลิ้ง เช่น Suzuki และ Sonogashira couplings ซึ่งจำเป็นสำหรับการสร้างพันธะคาร์บอน-คาร์บอนในโมเลกุลอินทรีย์ที่ซับซ้อน