ใช้เป็นสารตั้งต้นสำคัญในการสังเคราะห์ยาเภสัชกรรม โดยเฉพาะในการพัฒนาสารเคมีเกษตรและโมเลกุลที่มีฤทธิ์ทางชีวภาพ โครงสร้างของสารช่วยให้สามารถทำการฟังก์ชันนาไลเซชันได้ง่าย ทำให้มีคุณค่าในเคมียารักษาเพื่อสร้างสารประกอบที่มีความคงตัวทางเมแทบอลิซึมเพิ่มขึ้นและความสัมพันธ์ในการจับมัดที่สูงขึ้น ใช้กันทั่วไปในการเตรียมตัวยับยั้งคินาสและสารกำจัดวัชพืช เนื่องจากกลุ่มไตรฟลูออร์เมทอกซีที่มีฤทธิ์ดึงอิเล็กตรอนช่วยปรับปรุงลิโพฟิลิกและความต้านทานต่อการย่อยสลายแบบออกซิเดชัน นอกจากนี้ยังนำไปใช้ในการออกแบบยาฆ่าแมลงชนิดใหม่ โดยที่เฮเทอโรไซเคิลฟลูออรีนช่วยเพิ่มความคงตัวในสิ่งแวดล้อมและความเลือกสรรเป้าหมาย หมู่ไฮดรอกซีและไตรฟลูออร์เมทอกซีบนวงแหวนพิริดีนช่วยเสริมความคงตัวและฤทธิ์เฉพาะตัว