ใช้เป็นสารตั้งต้นสำคัญในการสังเคราะห์ยา โดยเฉพาะในการผลิตอนุพันธ์ของนิโคตินาไมด์อะดีนีนไดนิวคลีโอไทด์ (NAD) และสารประกอบชีวภาพอื่นๆ ทำหน้าที่เป็นส่วนประกอบพื้นฐานในการพัฒนายับยั้งคินาสและยาต้านไวรัส โครงสร้างของมันสนับสนุนการปรับแต่งในเคมียาเพื่อสร้างสารที่มีศักยภาพในการรักษาโรคทางระบบประสาทและโรคเมแทบอลิซึม นอกจากนี้ยังใช้ในอุตสาหกรรมเกษตรเคมีสำหรับการออกแบบยาฆ่าแมลงชนิดใหม่ เนื่องจากแกนไพริดีนช่วยเพิ่มการดูดซึมทางชีวภาพและความจำเพาะต่อเป้าหมาย