ใช้เป็นตัวกลางสำคัญในการสังเคราะห์ยา โดยเฉพาะในการพัฒนาสารเคมีเกษตรและโมเลกุลที่มีฤทธิ์ทางชีวภาพ หมู่ไตรฟลูโอมีทิลของมันช่วยเพิ่มความเสถียรทางเมแทบอลิซึมและลิโพฟิลิก ทำให้มีคุณค่าในการออกแบบสารประกอบที่มีกิจกรรมทางชีวภาพที่ดีขึ้น ใช้กันทั่วไปในการสร้างสารกำจัดวัชพืชและยาฆ่าแมลง เนื่องจากความสามารถในการปรับกิจกรรมเอนไซม์ในศัตรูพืช นอกจากนี้ยังใช้ในเคมียารักษาเพื่อสร้างระบบเฮเทโรไซคลิกที่มีไนโตรเจนซึ่งมีผลทางบำบัดที่เป็นไปได้