ใช้เป็นสารตั้งต้นสำคัญในการสังเคราะห์ยา โดยเฉพาะในการพัฒนายับยั้งคินาสสำหรับการรักษามะเร็ง เป็นส่วนประกอบพื้นฐานในการเตรียมส่วนประกอบยาสำคัญ (APIs) ที่มุ่งเป้าไปที่โรคทางเดินหายใจและภาวะอักเสบ โครงสร้าง trifluoromethylpyridine ช่วยเพิ่มความเสถียรทางเมแทบอลิซึมและความสามารถในการจับกับโมเลกุลยา ใช้อย่างแพร่หลายในเคมีเภสัชกรรมสำหรับการศึกษาความสัมพันธ์โครงสร้าง-กิจกรรม (SAR) เนื่องจากคุณสมบัติทางกายภาพและเคมีที่เหมาะสม นอกจากนี้ยังใช้ในการผลิตสารเคมีเกษตร โดยช่วยเพิ่มประสิทธิภาพของยาฆ่าแมลงและสารกำจัดวัชพืชบางชนิด