ใช้เป็นตัวกลางในการสังเคราะห์ยา โดยเฉพาะในการพัฒนายาที่มีฐานซัลโฟนาไมด์ซึ่งมีคุณสมบัติต้านจุลชีพและต้านการอักเสบ ทำหน้าที่เป็นส่วนประกอบพื้นฐานในเคมียารักษาโรค เนื่องจากสามารถสร้างอนุพันธ์ที่เสถียรเพื่อเพิ่มการดูดซึมของยาและความจำเพาะต่อเป้าหมาย นอกจากนี้ยังใช้ในการเตรียมตัวยับยั้งคินาสและสารประกอบที่มีกิจกรรมทางชีวภาพอื่นๆ ในงานวิจัย หมู่ซัลโฟนาไมด์ช่วยอำนวยการโต้ตอบกับเอนไซม์และโปรตีน ทำให้มีคุณค่าในการออกแบบตัวยับยั้งเอนไซม์