ใช้เป็นตัวกลางสำคัญในการสังเคราะห์ยา โดยเฉพาะในการพัฒนายับยั้งตัวรับเซโรโทนิน กลุ่มซัลโฟนิลคลอไรด์ทำปฏิกิริยากับเอมีนได้ง่ายเพื่อก่อตัวซัลโฟนามายด์ ซึ่งเป็นโครงสร้างทั่วไปในโมเลกุลชีวภาพ นอกจากนี้ยังใช้ในการเตรียมตัวยับยั้งคินาสและยารักษาอื่นๆ ที่มุ่งเป้าโรคทางระบบประสาทและจิตเวช กลุ่มเมทอกซี่ช่วยเพิ่มความเลือกในการแปลงบางประการ ทำให้มีคุณค่าในการสังเคราะห์เคมีละเอียดและการวิจัยค้นพบยา