ใช้เป็นสารตั้งต้นสำคัญในการสังเคราะห์สารเคมีเกษตร โดยเฉพาะสารกำจัดวัชพืชและสารควบคุมการเจริญเติบโตของพืช โครงสร้างฟลูออรีนช่วยเพิ่มการดูดซึมทางชีวภาพและความจำเพาะต่อเป้าหมายในตัวแทนป้องกันพืช นอกจากนี้ยังนำมาใช้ในเคมียาสำหรับพัฒนายาเภสัชที่มีฟลูออรีน เนื่องจากช่วยปรับปรุงความเสถียรทางเมแทบอลิซึมและความสามารถในการจับติดเป้าหมาย ใช้อย่างแพร่หลายในงานวิจัยเพื่อสร้างระบบเฮเทโรไซคลิกที่ซับซ้อน