2-เมทอกซี-3-ไนโตรพิริดีน-4-อะมีน ใช้เป็นสารระหว่างกลางในการสังเคราะห์สารประกอบทางเภสัชกรรม โดยเฉพาะในการพัฒนายับยั้ง kinase และโมเลกุลชีวภาพอื่นๆ โครงสร้างของมัน ซึ่งประกอบด้วยวงแหวนพิริดีนที่มีหมู่เมทอกซีที่ตำแหน่ง 2 หมู่ไนโตรที่ตำแหน่ง 3 และหมู่อะมีนที่ตำแหน่ง 4 ช่วยให้สามารถทำการฟังก์ชันนาไลเซชันเพิ่มเติมผ่านปฏิกิริยา เช่น การลดหมู่ไนโตรเป็นอะมีน หรือการแทนที่นิวคลีโอไฟล์ที่ตำแหน่งที่ถูกกระตุ้น คุณสมบัตินี้ทำให้มีคุณค่าในเคมีทางการแพทย์สำหรับการสร้างอนุพันธ์ที่มีศักยภาพต้านการอักเสบ ต้านมะเร็ง หรือต้านจุลชีพ นอกจากนี้ยังใช้ในงานวิจัยเพื่อสร้างระบบเฮเทโรไซคลิกซับซ้อนสำหรับการค้นพบยา