ใช้เป็นตัวกลางสำคัญในการสังเคราะห์สารประกอบทางเภสัชกรรม โดยเฉพาะในการพัฒนายับยั้งคินาสสำหรับการรักษามะเร็ง หมู่อัลไคน์ช่วยให้เกิดปฏิกิริยาคลิกเคมี (click chemistry) ได้อย่างมีประสิทธิภาพ ทำให้มีคุณค่าในเคมียารักษาโรคสำหรับการสร้างโมเลกุลซับซ้อน รวมถึงการเชื่อมต่อกับชีวโมเลกุล นอกจากนี้ยังใช้ในการเตรียมโครงสร้างโลหะ-อินทรีย์ (MOFs) เนื่องจากความสามารถในการจับกับไอออนโลหะ ส่งเสริมคุณสมบัติการเร่งปฏิกิริยาในกระบวนการแปลงสารอินทรีย์บางชนิด