ใช้เป็นสารตั้งต้นหลักในการสังเคราะห์ยา โดยเฉพาะในการพัฒนาตัวยับยั้ง kinase สำหรับการรักษามะเร็ง โครงสร้างของมันช่วยให้สามารถจับแบบเลือกสรรในระบบชีวภาพ ทำให้มีคุณค่าในเภสัชเคมี นอกจากนี้ยังใช้ในเคมีภัณฑ์เกษตรเพื่อสร้างสารกำจัดศัตรูพืชชนิดใหม่ที่มีประสิทธิภาพสูงขึ้น แกน fluoropyridine ช่วยเพิ่มความเสถียรทางเมแทบอลิซึมและการดูดซึมทางชีวภาพในสารประกอบที่ใช้งานได้สุดท้าย ใช้กันทั่วไปในปฏิกิริยาครอสคัปปลิงเพื่อสร้างโมเลกุลที่ซับซ้อนในงานวิจัยและการตั้งอุตสาหกรรม