ใช้เป็นสารตั้งต้นสำคัญในการสังเคราะห์ยา โดยเฉพาะในการพัฒนายับยั้ง kinase และโมเลกุลชีวภาพอื่นๆ ที่มุ่งเป้าไปยังโรคอักเสบและมะเร็ง โครงสร้างของมันช่วยให้สามารถทำการฟังก์ชันนาไลเซชันแบบเลือกเฉพาะได้ ทำให้มีคุณค่าในเคมียารักษาโรคสำหรับการสร้างสารประกอบเฮเทอโรไซคลิกที่ซับซ้อน ใช้กันอย่างแพร่หลายในการวิจัยสารเคมีเกษตรเพื่อออกแบบยาฆ่าแมลงและสารกำจัดวัชพืชใหม่ เนื่องจากแกนพิริดีนมีคุณสมบัติการจับตัวที่เหมาะสม นอกจากนี้ยังใช้ในการสังเคราะห์อินทรีย์เพื่อนำเสนอโมติฟพิริดีนที่ fluorinated และ chlorinated ซึ่งช่วยเพิ่มความเสถียรทางเมแทบอลิซึมและลิโพฟิลิกในตัวยาที่เป็นผู้สมัคร