ใช้เป็นสารตั้งต้นในการสังเคราะห์สารเคมีเกษตร โดยเฉพาะสารกำจัดวัชพืชและยาฆ่าแมลง เนื่องจากมีกลุ่มฮาโลเจนที่ทำปฏิกิริยาได้และวงแหวนไพรีดีนที่เสถียร โครงสร้างของมันช่วยให้สามารถดัดแปลงได้อย่างเลือกสรร ทำให้มีคุณค่าในการพัฒนายาเกษตร นอกจากนี้ยังใช้ในการผลิตยาเภสัชกรรมที่ไพรีดีนคลอรีนทำหน้าที่เป็นส่วนประกอบพื้นฐานสำหรับส่วนผสมที่ใช้งานได้ พบบ่อยในงานวิจัยสำหรับการออกแบบโมเลกุลชีวภาพใหม่