ใช้เป็นสารตัวกลางสำคัญในการสังเคราะห์ยา โดยเฉพาะในการพัฒนายับยั้ง kinase และสารประกอบที่มีฤทธิ์ทางชีวภาพอื่นๆ โครงสร้างพิริดีนที่ถูกฟลูออรีนแทนที่ช่วยเพิ่มความเสถียรทางเมแทบอลิซึมและความสามารถในการจับกับโมเลกุลยา ใช้อย่างแพร่หลายในอุตสาหกรรมเกษตรเคมีสำหรับการสร้างสารกำจัดวัชพืชและยาฆ่าแมลง เนื่องจากช่วยเพิ่ม lipophilicity และความคงทนต่อสิ่งแวดล้อม นอกจากนี้ยังใช้ในวิทยาศาสตร์วัสดุสำหรับการออกแบบเซมิคอนดักเตอร์อินทรีย์และผลึกเหลว โดยอะตอมฟลูออรีนมีอิทธิพลต่อคุณสมบัติทางอิเล็กทรอนิกส์และการจัดเรียงโมเลกุล หมู่ฟลูออรีนที่ตำแหน่ง 2 และ 3 ช่วยเพิ่มความเสถียรและฤทธิ์ของสารออกฤทธิ์ทางเภสัชกรรม