ใช้ในสังเคราะห์สารประกอบทางเภสัชกรรม โดยเฉพาะเป็นสารตั้งต้นในการผลิตยาที่มีโครงสร้างของพิริดีนที่มีการแทนที่ด้วยไอโอดีน ซึ่งช่วยเพิ่มความสามารถในการจับกับเป้าหมายทางชีวภาพ เช่น เอนไซม์หรือรีเซพเตอร์ นิยมใช้ในงานวิจัยด้านยาต้านมะเร็ง ยาแก้อักเสบ และยาที่เกี่ยวข้องกับระบบประสาท นอกจากนี้ยังใช้เป็นตัวกลางในการสร้างสารเรืองแสงหรือสารติดตามในงานวิเคราะห์ทางชีวเคมี เนื่องจากไอโอดีนช่วยเพิ่มมวลโมเลกุลและสามารถทำปฏิกิริยาต่อไปได้ผ่านกระบวนการแทนที่นิวคลีโอไฟล์