ใช้เป็นสารตั้งต้นสำคัญในการสังเคราะห์ยา โดยเฉพาะในการพัฒนายับยั้ง kinase สำหรับการรักษาโรคมะเร็ง โครงสร้างฟลูออรีนช่วยเพิ่มความเสถียรทางเมแทบอลิซึมและความสามารถในการจับกับโปรตีนเป้าหมาย ใช้บ่อยในเคมียารักษาเพื่อปรับปรุงคุณสมบัติเภสัชจลนศาสตร์ เช่น การดูดซึมทางชีวภาพและครึ่งชีวิต นอกจากนี้ยังใช้ในอุตสาหกรรมเกษตรเคมีสำหรับสร้างส่วนผสมออกฤทธิ์ที่มีประสิทธิภาพสูงขึ้นและความเสถียรต่อสิ่งแวดล้อม