ใช้เป็นสารตั้งต้นในการสังเคราะห์ยาในอุตสาหกรรมเภสัชกรรม โดยเฉพาะในการพัฒนายับยั้ง kinase และโมเลกุลชีวภาพอื่นๆ ทำหน้าที่เป็นส่วนประกอบพื้นฐานในเคมียารักษาโรค เนื่องจากมีกลุ่มฟังก์ชันคลอโรและคาร์บอกซาไมด์ ซึ่งช่วยให้สามารถทำการแทนที่และดัดแปลงได้อย่างเลือกสรร ใช้กันทั่วไปในการเตรียมสารประกอบที่กำหนดเป้าหมายโรคอักเสบ โรคระบบประสาท และมะเร็งบางชนิด นอกจากนี้ยังใช้ในการวิจัยเคมีเกษตรสำหรับการออกแบบยาฆ่าแมลงและสารกำจัดวัชพืชใหม่ เนื่องจากแกนไพรีดีนช่วยเพิ่ม bioavailability และความจำเพาะต่อเป้าหมาย