ใช้เป็นสารตั้งต้นสำคัญในการสังเคราะห์สารประกอบทางเภสัชกรรม โดยเฉพาะในการพัฒนายับยั้ง kinase สำหรับการบำบัดมะเร็งแบบกำหนดเป้าหมาย ลักษณะการแทนที่ด้วยฮาโลเจนช่วยให้เกิดปฏิกิริยาการจับคู่ข้ามแบบเลือกเฉพาะ ซึ่งช่วยในการสร้างระบบเฮเตอร์โรไซคลิกที่ซับซ้อนอย่างแม่นยำ ใช้กันอย่างแพร่หลายในเคมีทางการแพทย์สำหรับการศึกษาความสัมพันธ์ระหว่างโครงสร้างและกิจกรรม (SAR) เนื่องจากความแตกต่างในการตอบสนองของกลุ่มโบรโม ฟลูออโร และไอโอโด นอกจากนี้ยังใช้ในการเตรียมยาต้านไวรัสและสารเคมีทางการเกษตร ซึ่งโครงสร้าง pyridine ที่ fluorinated ช่วยเพิ่มความเสถียรทางเมแทบอลิซึมและการมีชีวเภสัชจลนศาสตร์