ใช้เป็นสารกลางสำคัญในการสังเคราะห์สารประกอบทางเภสัชกรรม โดยเฉพาะในการพัฒนาสารออกฤทธิ์ทางเภสัชกรรม (APIs) ที่ต้องการโครงสร้าง piperidine หรือ tetrahydropyridine ที่ถูกแทนที่ กลุ่มอะมีนที่ถูกป้องกันด้วย Boc ช่วยให้สามารถทำปฏิกิริยาแบบเลือกสรรที่ตำแหน่งฟังก์ชันอื่นๆ ทำให้มีคุณค่าต่อการสังเคราะห์อินทรีย์แบบหลายขั้นตอน ใช้กันทั่วไปในเคมียารักษาเพื่อสร้างวงแหวนเฮเทอโรไซคลิกที่มีไนโตรเจนซึ่งพบในโมเลกุลชีวภาพที่มีฤทธิ์ โครงสร้างที่ป้องกันด้วย Boc ช่วยเพิ่มความเสถียรและความละลายในระหว่างการคู่เปปไทด์และปฏิกิริยาการควบแน่นอื่นๆ ใช้อย่างแพร่หลายในงานวิจัยสำหรับการค้นพบยา โดยเฉพาะในตัวยาสำหรับระบบประสาทส่วนกลางและตัวยับยั้ง kinase