ใช้เป็นตัวกลางสำคัญในการสังเคราะห์ยา โดยเฉพาะในการพัฒนายับยั้งคินาสและสารประกอบที่มีฤทธิ์ทางชีวภาพอื่นๆ โครงสร้างของมันช่วยให้สามารถทำการฟังก์ชันนาไลเซชันแบบเลือกเฉพาะได้ ทำให้มีคุณค่าในเคมียารักษาโรคสำหรับการสร้างระบบเฮเทโรไซคลิกที่ซับซ้อน ใช้กันทั่วไปในปฏิกิริยาครอส-คัปพลิง เช่น Suzuki หรือ Buchwald-Hartwig aminations เพื่อนำแกนไพริดีนเข้าไปในโมเลกุลเป้าหมาย นอกจากนี้ยังใช้ในงานวิจัยเกษตรเคมีสำหรับการออกแบบยาฆ่าแมลงและสารกำจัดวัชพืชใหม่ เนื่องจากกลุ่มไนไตรล์และฮาโลเจนที่เป็นตัวดึงอิเล็กตรอนช่วยเพิ่มความสัมพันธ์ในการจับและความเสถียรทางเมแทบอลิซึม