ใช้เป็นตัวกลางสำคัญในการสังเคราะห์สารประกอบทางเภสัชกรรม โดยเฉพาะในการพัฒนายับยั้ง kinase และยาต้านไวรัส โครงสร้างของมันช่วยให้สามารถทำการฟังก์ชันนาไลเซชันแบบเลือกเฉพาะได้ ทำให้มีคุณค่าสูงในเคมียารักษาในการสร้างการบำบัดแบบกำหนดเป้าหมาย ใช้กันทั่วไปในปฏิกิริยาครอส-คัปเปลิง เช่น Suzuki หรือ Buchwald-Hartwig aminations เพื่อสร้างระบบเฮเทอโรไซคลิกที่ซับซ้อน นอกจากนี้ ยังใช้ในการเตรียม PET radiotracers เนื่องจากมีไอโอดีน ซึ่งช่วยให้สามารถนำไปประยุกต์ใช้ในการถ่ายภาพสำหรับประสาทวิทยาและมะเร็งวิทยา หมู่ฟลูออรีนและไอโอดีนช่วยเพิ่มความสามารถในการจับกับเป้าหมายทางชีวภาพและปรับปรุงคุณสมบัติเภสัชจลนศาสตร์