ใช้เป็นตัวกลางสำคัญในการสังเคราะห์ยาเภสัชกรรม โดยเฉพาะในการพัฒนาสารเคมีเกษตรและโมเลกุลที่มีฤทธิ์ทางชีวภาพ โครงสร้างไพริดีนที่มีฮาโลเจนทำให้มีคุณค่าต่อปฏิกิริยาการจับคู่ข้าม เช่น Suzuki หรือ Buchwald-Hartwig aminations ซึ่งช่วยในการสร้างระบบเฮเทโรไซคลิกที่ซับซ้อน การมีทั้งกลุ่มโบรมีนและไตรฟลูออโรมอกซีช่วยให้สามารถทำการฟังก์ชันนาไลเซชันแบบเลือกเพศได้ สนับสนุนการปรับปรุงคุณสมบัติเภสัชจลนศาสตร์ในโปรแกรมค้นคว้ายา มักใช้ในงานวิจัยสำหรับการออกแบบตัวยับยั้งคินาสและตัวปรับตัวรับ