ใช้เป็นสารกลางสำคัญในการสังเคราะห์ยา โดยเฉพาะในการพัฒนายาที่ปรับตัวรับนิโคตินิกและยาสำหรับระบบประสาทส่วนกลาง หมู่คลอโรเมทิลที่ทำปฏิกิริยาได้ช่วยให้เกิดการอัลคิลเลชันหรือการเชื่อมต่อกับโครงสร้างโมเลกุลอื่นๆ ได้ง่าย ทำให้มีคุณค่าในเคมียารักษาโรคสำหรับการสร้างสารประกอบเฮเทโรไซคลิกที่ซับซ้อน ใช้กันทั่วไปในการเตรียมยาที่มีฐานพิริดีน รวมถึงยาที่เล็งเป้าไปที่โรคทางระบบประสาทและการอักเสบ นอกจากนี้ยังใช้ในงานวิจัยด้านเกษตรเคมีสำหรับการออกแบบยาฆ่าแมลงชนิดใหม่ที่มีความเลือกสรรที่ดีขึ้น