ใช้เป็นสารกลางสำคัญในการสังเคราะห์เภสัชภัณฑ์ โดยเฉพาะในการพัฒนาสารเคมีเกษตรและโมเลกุลชีวภาพที่มีฤทธิ์ โครงสร้างของมันช่วยให้สามารถทำการฟังก์ชันนาไลเซชันแบบเลือกเฉพาะได้ ทำให้มีคุณค่าในการสร้างสารกำจัดวัชพืชและสารควบคุมการเจริญเติบโตของพืช กลุ่มโบรโมและไดฟลูออโรมิทอกซีช่วยให้เกิดปฏิกิริยาครอส-คัปปลิ้ง ซึ่งใช้กันทั่วไปในการสร้างระบบเฮเทอโรไซคลิกที่ซับซ้อนสำหรับสารป้องกันพืช นอกจากนี้ยังใช้ในการวิจัยเพื่อออกแบบสารประกอบใหม่ที่มีความเสถียรทางเมแทบอลิซึมที่ดีขึ้นและความจำเพาะต่อเป้าหมาย