6-Chloro-4-iodopyridin-2-amine ถูกใช้หลักในการสังเคราะห์อินทรีย์เป็นสารกลางที่หลากหลายสำหรับการพัฒนาสารประกอบเคมีที่ซับซ้อนมากขึ้น โครงสร้างของมันที่มีทั้งสารย่อยคลอโรและไอโอโด ทำให้เป็นบล็อกก่อสร้างที่มีคุณค่ากในการเตรียมเภสัชภัณฑ์ โดยเฉพาะในการสังเคราะห์สารประกอบเฮเตอร์โรไซคลิกที่แสดงกิจกรรมทางชีวภาพ

ในการเคมียารักษา มันมักถูกใช้ในการสร้างผู้สมัครยาที่มีศักยภาพ โดยเฉพาะที่มุ่งเป้าไปยังความผิดปกติทางระบบประสาทหรือโรคติดเชื้อ การมีอะตอมฮาโลเจนช่วยให้สามารถทำหน้าที่เพิ่มเติมผ่านปฏิกิริยาการจับคู่ข้าม เช่น Suzuki หรือ Sonogashira couplings ซึ่งช่วยให้สามารถนำเสนอชิ้นส่วนโมเลกุลที่หลากหลาย

นอกจากนี้ สารประกอบนี้ถูกใช้ในการวิจัยสารเคมีเกษตรสำหรับการพัฒนายาฆ่าแมลงหรือสารกำจัดวัชพืชใหม่ๆ โดยแกนไพรีดีนของมันสามารถถูกปรับปรุงเพื่อเพิ่มประสิทธิภาพและความเลือกสรร บทบาทของมันในวิทยาศาสตร์วัสดุก็สำคัญ ช่วยในการสังเคราะห์วัสดุอิเล็กทรอนิกส์อินทรีย์หรือลิแกนด์สำหรับระบบเร่งปฏิกิริยา โดยรวม การใช้งานของมันครอบคลุมหลายสาขา เน้นย้ำถึงความสำคัญในงานวิจัยและพัฒนาเคมีขั้นสูง