6-(Difluoromethyl)pyridin-2-amine ถูกใช้หลักๆ ในด้านสารเคมีเกษตร เป็นสารกลางสำคัญในการสังเคราะห์ยาฆ่าแมลงและยาฆ่าหญ้าต่างๆ กลุ่มไดฟลูออโรเมทิลช่วยเพิ่มกิจกรรมทางชีวภาพของสารประกอบที่เกิดขึ้น ทำให้มีประสิทธิภาพในการควบคุมศัตรูพืชและวัชพืชหลากหลาย นอกจากนี้ สารเคมีนี้ยังถูกนำมาใช้ในการวิจัยเภสัชกรรมเพื่อพัฒนายาใหม่ โดยเฉพาะยาที่เล็งเป้าไปยังเอนไซม์หรือตัวรับ ซึ่งกลุ่มไดฟลูออโรเมทิลสามารถปรับปรุงความสามารถในการจับและความเสถียรทางเมแทบอลิซึม ความยืดหยุ่นในการสังเคราะห์อินทรีย์ยังทำให้มีคุณค่าในการสร้างโมเลกุลซับซ้อนสำหรับการศึกษาทางเคมีเพิ่มเติม