5-Bromo-6-iodopyridin-2-amine ใช้หลักๆ เป็นส่วนประกอบพื้นฐานในการสังเคราะห์อินทรีย์ สารนี้มีคุณค่าในการพัฒนายาและสารเคมีเกษตร โครงสร้างของมันช่วยให้สามารถปรับแต่งเพิ่มเติมได้ ทำให้เป็นสารกลางสำคัญในการสร้างโมเลกุลที่ซับซ้อน โดยเฉพาะอย่างยิ่งมีประโยชน์ในการทำปฏิกิริยาครอส-คัปปลิ้ง เช่น Suzuki หรือ Buchwald-Hartwig เพื่อสร้างพันธะคาร์บอน-คาร์บอนหรือคาร์บอน-ไนโตรเจน ปฏิกิริยาเหล่านี้จำเป็นในการสังเคราะห์สารชีวภาพที่ออกฤทธิ์ รวมถึงผู้สมัครยาที่มีศักยภาพ นอกจากนี้ ยังสามารถใช้เป็นสารตั้งต้นในการเตรียมสารประกอบเฮเทอโรไซคลิก ซึ่งมักถูกสำรวจเพื่อคุณสมบัติทางบำบัด