4-Methoxypyridine-2,6-dicarboxylic acid ใช้เป็นสารกลางสำคัญในการสังเคราะห์สารประกอบเภสัชภัณฑ์ โดยเฉพาะอย่างยิ่งในการพัฒนายาที่มุ่งเป้าไปยังความผิดปกติทางระบบประสาท มีบทบาทในการผลิตลิแกนด์สำหรับคอมเพล็กซ์การประสานของโลหะ ซึ่งนำไปประยุกต์ใช้ในกระบวนการคาตาไลซิสและวิทยาศาสตร์วัสดุ นอกจากนี้ ยังทำหน้าที่เป็นหน่วยย่อยก่อสร้างในเคมีอินทรีย์สำหรับการสร้างโมเลกุลที่มีกิจกรรมทางชีวภาพ รวมถึงตัวยับยั้งและตัวปรับการทำงานของเอนไซม์ อนุพันธ์ของมันถูกสำรวจสำหรับการประยุกต์ใช้ที่เป็นไปได้ในเคมียารักษาและการค้นพบยา