4-โบรโม-2,6-ไดอะมิโนไพรีดิน ใช้หลักๆ เป็นสารกลางในการสังเคราะห์อินทรีย์ โดยเฉพาะในการผลิตเภสัชภัณฑ์และสารเคมีเกษตร โครงสร้างของมันช่วยให้ทำหน้าที่เป็นส่วนประกอบพื้นฐานสำหรับโมเลกุลที่ซับซ้อนมากขึ้น มักมีส่วนในการพัฒนายาที่เล็งเป้าหมายไปยังเส้นทางชีวภาพเฉพาะ นอกจากนี้ ยังมีการประยุกต์ใช้ในการสังเคราะห์สีย้อมและเม็ดสี เนื่องจากความสามารถในการสร้างสารประกอบสีที่เสถียรและสดใส ในด้านวิทยาศาสตร์วัสดุ ใช้ในการสร้างโพลิเมอร์ขั้นสูงและคอมเพล็กซ์การประสาน ซึ่งจำเป็นสำหรับการพัฒนาวัสดุใหม่ที่มีคุณสมบัติเฉพาะเจาะจง บทบาทในงานวิจัยและพัฒนามีความสำคัญ เนื่องจากช่วยในการสำรวจปฏิกิริยาเคมีและกระบวนการใหม่ๆ