4,6-Dichloropicolinaldehyde ใช้หลักในการสังเคราะห์สารเคมีเกษตร โดยทำหน้าที่เป็นสารกลางสำคัญในการผลิตสารกำจัดวัชพืชและสารกำจัดศัตรูพืช โครงสร้างของมันช่วยในการพัฒนาโมเลกุลที่เล็งเป้าไปที่ชนิดวัชพืชเฉพาะเจาะจง เพิ่มการป้องกันพืชผล นอกจากนี้ ยังใช้ในอุตสาหกรรมเภสัชกรรมในการสร้างส่วนประกอบที่ใช้งานได้ในยา โดยเฉพาะยาที่ต้องการอนุพันธ์พิโคไลน์ที่มีคลอรีน ในงานวิจัย มันทำหน้าที่เป็นบล็อกก่อสร้างสำหรับการพัฒนาสารประกอบอินทรีย์ใหม่ๆ ช่วยในการสำรวจปฏิกิริยาเคมีและเส้นทางใหม่ๆ