3-Phenoxypyridin-2-amine ใช้หลักในการสังเคราะห์อินทรีย์ โดยทำหน้าที่เป็นสารกลางสำคัญในการผลิตสารประกอบที่มีฤทธิ์ทางเภสัชวิทยาต่างๆ โครงสร้างที่มีทั้งวงแหวนไพรีดีนและกลุ่มฟีโนกซี ทำให้เป็นบล็อกก่อสร้างที่หลากหลายสำหรับการพัฒนายา โดยเฉพาะยาที่ขัดต่อภาวะทางระบบประสาทและการอักเสบ สารนี้มักใช้ในการสังเคราะห์โมเลกุลเฮเทอโรไซคลิก ซึ่งสำคัญในการออกแบบตัวแทนบำบัดใหม่ นอกจากนี้ การประยุกต์ใช้ยังขยายไปสู่การวิจัยและพัฒนาในเคมียารักษาโรค โดยใช้ในการสำรวจความสัมพันธ์โครงสร้าง-กิจกรรมและปรับปรุงประสิทธิภาพยา คุณสมบัติเฉพาะของสารยังทำให้เป็นผู้สมัครสำหรับการพัฒนาสารเคมีเกษตร สนับสนุนการสร้างยาฆ่าแมลงและสารกำจัดวัชพืชใหม่