สารเอทิล 2-อะมิโน-5-ไอโอโดนิโคติเนต ถูกใช้หลักๆ เป็นสารกลางสำคัญในการสังเคราะห์อินทรีย์ โดยเฉพาะในการพัฒนายาและสารเคมีเกษตร โครงสร้างของมันช่วยให้สามารถทำการฟังก์ชันนาไลเซชันเพิ่มเติม ทำให้มีคุณค่าในการสังเคราะห์โมเลกุลที่ซับซ้อน มักถูกนำมาใช้ในการเตรียมส่วนประกอบยาสำคัญ (APIs) สำหรับยาที่เล็งเป้าไปยังโรคต่างๆ รวมถึงมะเร็งและโรคติดเชื้อ นอกจากนี้ หมู่ไอโอดีนของมันทำให้เป็นบล็อกก่อสร้างที่มีประโยชน์ในการทำปฏิกิริยาครอส-คัปพลิง เช่น ปฏิกิริยาซูซูกิหรือโซโนกาชิรา ซึ่งสำคัญในการสร้างสารประกอบที่มีฤทธิ์ทางชีวภาพ ในการวิจัยสารเคมีเกษตร มันทำหน้าที่เป็นสารตั้งต้นในการพัฒนายาฆ่าแมลงและสารกำจัดวัชพืชใหม่ๆ ความหลากหลายและปฏิกิริยาของมันทำให้เป็นเครื่องมือที่มีคุณค่าในการเคมียารักษาและกระบวนการค้นพบยา