2,3-Dichloroisonicotinaldehyde ใช้หลัก ๆ เป็นสารกลางในการสังเคราะห์สารประกอบยาต่าง ๆ โครงสร้างของมันช่วยให้เป็นส่วนประกอบหลักในการพัฒนาสารออกฤทธิ์ทางเภสัชกรรม (APIs) โดยเฉพาะที่มุ่งเป้าไปยังโรคทางระบบประสาทและโรคติดเชื้อ นอกจากนี้ ยังเป็นสารตั้งต้นในการผลิตสารเคมีเกษตร ช่วยในการสร้างสารกำจัดวัชพืชและยาฆ่าแมลงที่ปกป้องพืชผลจากศัตรูพืชและโรค สารนี้ยังถูกใช้ในการวิจัยเคมีอินทรีย์เพื่อพัฒนาสารประกอบเฮเตอร์โรไซคลิกใหม่ ซึ่งมีศักยภาพในการประยุกต์ใช้ในวิทยาศาสตร์วัสดุและการค้นพบยา ความหลากหลายในการทำปฏิกิริยาเคมีทำให้เป็นส่วนประกอบที่มีคุณค่าในการสังเคราะห์โมเลกุลที่ซับซ้อน