สารประกอบนี้ถูกนำมาใช้หลักๆ ในสาขาเคมียารักษาโรคเป็นสารกลางสำคัญในการสังเคราะห์โมเลกุลที่มีฤทธิ์ทางชีวภาพหลากหลาย โครงสร้างของมันมีคุณค่าอย่างยิ่งในการพัฒนายา โดยเฉพาะยาที่มุ่งเป้าไปยังโรคของระบบประสาทส่วนกลางและภาวะอักเสบ นักวิจัยใช้แกน imidazopyridazine เพื่อออกแบบสารประกอบที่มีผลทางรักษาศักยภาพ เช่น การยับยั้งเอนไซม์หรือการปรับเปลี่ยนตัวรับ นอกจากนี้ ยังทำหน้าที่เป็นบล็อกก่อสร้างในกระบวนการสังเคราะห์อินทรีย์สำหรับสร้างสารประกอบเฮเตอร์โรไซคลิกที่ซับซ้อน ซึ่งมักถูกสำรวจเพื่อคุณสมบัติทางเภสัชวิทยา การประยุกต์ใช้ยังปรากฏในการพัฒนายารักษาโรคใหม่สำหรับโรคเช่นมะเร็ง ซึ่งอนุพันธ์ของมันอาจแสดงกิจกรรมที่น่าจะเป็นไปได้