ใช้ในกระบวนการสังเคราะห์สารประกอบทางเคมีที่มีโครงสร้างไซโคลโพรเพนเป็นแกนหลัก โดยเฉพาะในงานวิจัยด้านเภสัชกรรม ซึ่งโครงสร้างไซโคลโพรเพนช่วยเพิ่มความเสถียรและฤทธิ์ทางชีวภาพให้กับโมเลกุล สารนี้ทำหน้าที่เป็นตัวตั้งต้น (building block) ในการสร้างสารที่มีฤทธิ์ต่อระบบประสาทส่วนกลาง เช่น สารต้านอาการชัก หรือสารกระตุ้นประสาท นอกจากนี้ยังนำไปใช้ในการพัฒนายาต้านไวรัสและสารต้านจุลชีพในบางกรณี โดยอาศัยคุณสมบัติของหมู่ไซยาโนและหมู่คาร์บอกซิลิกที่สามารถทำปฏิกิริยาต่อไปได้หลากหลายรูปแบบ