N-(1-Pyrenyl)maleimide ถูกใช้อย่างกว้างขวางเป็นสารเคมีสำหรับติดฉลากแบบเรืองแสงในงานวิจัยทางชีวเคมีและชีวฟิสิกส์ กลุ่ม pyrene ให้การเรืองแสงที่แข็งแกร่ง ทำให้มีคุณค่าในการติดแท็กโปรตีน เปปไทด์ และโมเลกุลชีวภาพอื่นๆ เพื่อศึกษากโครงสร้าง พลวัต และปฏิสัมพันธ์ของโมเลกุลเหล่านั้น โดยเฉพาะอย่างยิ่งมีประโยชน์ในการศึกษาการถ่ายโอนพลังงานแบบ Förster resonance energy transfer (FRET) เนื่องจากมีอายุการเรืองแสงที่ยาวนานและความสามารถในการก่อตัว excimer นอกจากนี้ ยังถูกนำมาใช้ในการพัฒนาเซ็นเซอร์ชีวภาพ (biosensors) และโพรบสำหรับการถ่ายภาพ (imaging probes) ซึ่งช่วยให้สามารถมองเห็นกระบวนการในเซลล์และเส้นทางโมเลกุลได้ การตอบสนองต่อกลุ่ม thiol ช่วยให้สามารถคอนจูเกตแบบเลือกสรรเฉพาะกับ cysteine residues ในโปรตีน สนับสนุนการติดฉลากแบบเฉพาะที่