APTS ถูกใช้อย่างแพร่หลายเป็นสารทำเครื่องหมายเรืองแสงในงานวิจัยทางชีวเคมีและชีววิทยาโมเลกุล โดยเฉพาะอย่างยิ่งในการทำเครื่องหมายคาร์โบไฮเดรตสำหรับการวิเคราะห์ด้วยเทคนิค capillary electrophoresis ซึ่งช่วยในการตรวจจับและจำแนกโมเลกุลน้ำตาลที่ซับซ้อน สารนี้ยังถูกนำมาใช้ในการศึกษากลัยโคโปรตีนและโพลีแซคคาไรด์ โดยให้ความไวและความละเอียดสูงในขั้นตอนการทดสอบแบบเรืองแสง นอกจากนี้ APTS ยังทำหน้าที่เป็นตัวบ่งชี้ในลำดับดีเอ็นเอและการประยุกต์ใช้อื่นๆ ที่ต้องการการติดแท็กแบบเรืองแแสงสว่าง เนื่องจากมีคุณสมบัติการเรืองแสงที่แข็งแกร่งและเสถียร ความละลายในน้ำและความเข้ากันได้กับเทคนิคการวิเคราะห์ต่างๆ ทำให้เป็นเครื่องมือที่มีคุณค่าต่อการวิจัยทางวิทยาศาสตร์