4-Methoxy-6-methyl-2-pyrazol-1-ylpyrimidine มีการนำไปประยุกต์ใช้หลักในสาขาเคมีเภสัชกรรม โดยทำหน้าที่เป็นสารตัวกลางสำคัญในการสังเคราะห์สารประกอบเภสัชกรรมต่างๆ โครงสร้างของมันมีคุณค่าอย่างยิ่งในการพัฒนาตัวยับยั้งโมเลกุลขนาดเล็ก ซึ่งมีความสำคัญในการกำหนดเป้าหมายไปยังเอนไซม์หรือโปรตีนเฉพาะที่เกี่ยวข้องกับเส้นทางการเป็นโรค สารประกอบนี้มักถูกนำมาใช้ในการออกแบบยารักษาโรคต่างๆ เช่น มะเร็ง การอักเสบ และโรคภูมิต้านตนเอง นอกจากนี้ หมู่ pyrimidine และ pyrazole ทำให้เป็นบล็อกก่อสร้างที่หลากหลายสำหรับสร้างสารประกอบที่มีศักยภาพต้านไวรัสและต้านจุลินทรีย์ นักวิจัยยังสำรวจการใช้ในเกษตรเคมี โดยเฉพาะในการพัฒนาสารกำจัดวัชพืชและยาฆ่าเชื้อรา เนื่องจากความสามารถในการรบกวนกระบวนการเมแทบอลิซึมของศัตรูพืชและพยาธิ นอกจากนี้ บทบาทในการสังเคราะห์อินทรีย์ยังขยายไปสู่การสร้างวัสดุใหม่และโพรบเคมีที่ใช้ในการวิจัยชีวเคมี