ใช้เป็นสารกลางสำคัญในการสังเคราะห์สารประกอบเภสัชภัณฑ์ โดยเฉพาะในการพัฒนายับยั้ง kinase สำหรับการรักษามะเร็ง กลุ่ม chloromethyl ที่ทำปฏิกิริยาได้ช่วยให้สามารถปรับเปลี่ยนหน้าที่ได้ง่าย ทำให้มีคุณค่าในการสร้างโครงสร้าง heterocyclic ซับซ้อนที่พบในโมเลกุลชีวภาพที่มีกิจกรรม ใช้กันอย่างแพร่หลายในเคมีทางการแพทย์สำหรับการศึกษาความสัมพันธ์ระหว่างโครงสร้างและกิจกรรม (SAR) เนื่องจากความสามารถในการเพิ่มความเข้มข้นของการจับและความเลือกสรร นอกจากนี้ยังใช้ในการเตรียมอนุพันธ์ที่อิงจาก pyrazolopyrimidine ซึ่งมีศักยภาพต้านไวรัสและต้านการอักเสบ