3-Iodo-1H-pyrazolo[3,4-c]pyridine เป็นสารประกอบที่นำไปใช้หลัก ๆ ในการวิจัยและพัฒนายาเภสัชกรรมในฐานะบล็อกก่อสร้างที่หลากหลายสำหรับการสังเคราะห์โมเลกุลที่ซับซ้อน โครงสร้างของมันช่วยให้ทำหน้าที่เป็นสารกลางสำคัญในการสร้างสารประกอบที่มีกิจกรรมทางชีวภาพ โดยเฉพาะในการออกแบบยาที่เล็งเป้าไปที่ความผิดปกติทางระบบประสาทและมะเร็ง อะตอมไอโอดีนในโมเลกุลช่วยอำนวยความสะดวกในการปรับโครงสร้างเพิ่มเติมผ่านปฏิกิริยาคัปปลิงต่าง ๆ ทำให้มีคุณค่าต่อเคมียารักษาในการสร้างยาตัวสมัครที่หลากหลาย นอกจากนี้ ยังถูกใช้ในการศึกษาการยับยั้งเอนไซม์และการจับกับตัวรับ เนื่องจากความสามารถในการเลียนแบบโครงสร้างทางชีวภาพบางอย่าง การประยุกต์ใช้ขยายไปถึงการพัฒนาตัวแทนวินิจฉัยและโพรบสำหรับการศึกษาทางชีวเคมี